背景介紹:
蛋白質(zhì)組學(xué)研究可根據(jù)其研究焦點(diǎn)是否特定于某類蛋白質(zhì)而劃分為靶向蛋白質(zhì)組學(xué)與非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)兩個(gè)分支。靶向蛋白質(zhì)組學(xué)分析是一種專注于特定蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)組的研究方法,通過選擇性地檢測和定量目標(biāo)蛋白質(zhì),提供高靈敏度和高特異性的結(jié)果,用于深入研究蛋白質(zhì)功能和疾病機(jī)制。相較于非靶向蛋白質(zhì)組學(xué),靶向蛋白質(zhì)組學(xué)在準(zhǔn)確度、靈敏度和重現(xiàn)性方面均展現(xiàn)出更為優(yōu)越的性能,為蛋白質(zhì)組學(xué)的深入研究提供了更為精準(zhǔn)和可靠的工具。
此外,絕對(duì)定量分析是蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域中至關(guān)重要的技術(shù)手段,專門用于精確測定蛋白質(zhì)或肽段在樣本中的濃度或拷貝數(shù)。這一方法的核心在于利用已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)品(通常為同位素標(biāo)記肽段)進(jìn)行精確校準(zhǔn)。絕對(duì)定量分析對(duì)于基礎(chǔ)生物學(xué)研究及臨床應(yīng)用具有重要意義,它不僅能夠提供更準(zhǔn)確的蛋白質(zhì)表達(dá)信息,還有助于建立蛋白質(zhì)豐度數(shù)據(jù)庫,從而深化對(duì)生理過程和病理狀況下蛋白質(zhì)功能的理解。
技術(shù)優(yōu)勢:
① 專業(yè)技術(shù)優(yōu)勢:公司擁有先進(jìn)的質(zhì)譜平臺(tái)和資深專業(yè)團(tuán)隊(duì),提供全面、精準(zhǔn)的非靶向與靶向蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)。
② 豐富服務(wù)選項(xiàng):涵蓋多種靶向定量技術(shù)(PRM),滿足不同研究需求??筛鶕?jù)客戶需求定制實(shí)驗(yàn)方案,保障最優(yōu)實(shí)驗(yàn)效果。
③ 嚴(yán)謹(jǐn)質(zhì)量管理:成熟質(zhì)量管理體系,遵循ISO9001標(biāo)準(zhǔn),確保報(bào)告真實(shí)可信。
④ 從咨詢到報(bào)告交付,全程及時(shí)反饋進(jìn)度,確??蛻舻臐M意度與項(xiàng)目的高效執(zhí)行。
服務(wù)內(nèi)容:
技術(shù)平臺(tái):
科絡(luò)思生物提供基于質(zhì)譜技術(shù)的靶向與絕對(duì)定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù),旨在為客戶提供全面且深入的蛋白質(zhì)研究支持。
在靶向蛋白質(zhì)組學(xué)范疇內(nèi),科絡(luò)思采用PRM(parallel reaction monitoring)作為核心技術(shù)手段。PRM能夠極其敏感地檢測到低豐度的多肽片段,有效排除背景蛋白干擾,并實(shí)現(xiàn)高精度定量,從而有效驗(yàn)證和確認(rèn)非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)所揭示的生物學(xué)差異相關(guān)蛋白質(zhì)。
與傳統(tǒng)的靶向蛋白質(zhì)定量方法(如Western blot)相比,靶向蛋白質(zhì)組學(xué)方法無需發(fā)展抗體,可一次性檢測多個(gè)蛋白,必要時(shí)可實(shí)現(xiàn)絕對(duì)定量。
案例展示:
項(xiàng)目需求:為了深入探究藥物處理組與對(duì)照組細(xì)胞樣品中,藥物與某些特定關(guān)注蛋白的結(jié)合位點(diǎn),以揭示與藥物表型相關(guān)的分子機(jī)制。我們采用基于PRM技術(shù)的靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法,處理每組兩次生物學(xué)重復(fù)的樣本,實(shí)現(xiàn)對(duì)差異結(jié)合位點(diǎn)的精確鑒定和定量分析。
數(shù)據(jù)展示:塞利尼索(Selinexor, KPT330)通過共價(jià)結(jié)合抑制核蛋白輸出1(XPO1_C528_LVVVGAC*GVGK)活性從而治療多發(fā)性骨髓瘤和彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤。我們利用不同濃度KPT330處理HCT116細(xì)胞,采用高分辨質(zhì)譜技術(shù),實(shí)現(xiàn)了對(duì)目標(biāo)母離子的全面、精確的二級(jí)質(zhì)譜信息捕獲。這種技術(shù)使得我們能夠選擇性地、精確地檢測目標(biāo)蛋白和肽段。發(fā)現(xiàn)在1 μM 條件下,KPT330對(duì)XOP1_C528位點(diǎn)占據(jù)率即可接近100%,并且通過擬合曲線發(fā)現(xiàn),細(xì)胞內(nèi)位點(diǎn)結(jié)合能力EC50為241nM,與KPT330細(xì)胞抑制活性IC50(150-500nM)相當(dāng)。