產品系列二:光親和探針
許多活性小分子化合物,例如生物體代謝物,天然產物和藥物分子,都是以非共價的方式和靶點蛋白質發(fā)生動態(tài)可逆相互作用,當蛋白質在體外研究過程中一旦失活,則會破壞二者之間的結合力。在小分子化合物靶點鑒定,細胞分布成像和蛋白質標記等領域,光親和標記技術(Photoaffinity labeling, PAL)應用廣泛,它是一種共價捕獲小分子-生物大分子相互作用的常用方法,在外界紫外光刺激的條件下,化學探針上的光交聯基團(分類和特點見下表)能夠產生自由基、氮賓或卡賓,從而能夠快速共價標記空間上鄰近的生物大分子。
光交聯基團
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光照波長
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活性中間體
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優(yōu)點
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缺點
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苯甲酮 (Benzophenones) |
350-360 nm |
自由基 |
a) 商業(yè)易得; b) 光照波長不會造成生物性損傷 |
a) 化學結構較大; b) 光照時間長 |
疊氮苯 (Aryl Azides) |
<300 nm |
氮賓 |
a) 易合成; b) 化學結構小 |
a) 光照波長較短,可能會造成生物大分子的損傷; b) 易出現非特異性交聯 |
雙吖丙啶 (Diazirines) |
350-380 nm |
卡賓 |
a) 反應速率快; b) 化學結構?。?/span> c) 光照波長不會造成生物性損傷 |
a) 合成繁瑣; b) 可異構化生成重氮中間體 |
其中,雙吖丙啶結構以其生物兼容性強,化學結構小,反應速度快等特點,在小分子光親和生物正交探針中應用最為廣泛,科學家們相繼開發(fā)了帶有不同衍生化官能團(氨基、羧基或碘)的光交聯連接子,光交聯基團用于捕獲生物大分子,生物正交基團(例如炔基)作為報告基團,能夠后續(xù)偶聯熒光素和生物素,用于蛋白質信號檢測或富集分離。同時,新型高反應活性的光交聯連接子也在持續(xù)開發(fā)中。
將光交聯連接子與活性小分子偶聯,即產生具有生物活性的光親和生物正交探針,相比于傳統的生物素基團修飾改造,光交聯連接子體積小,對活性小分子結構,細胞穿膜能力等改動均較小,結合長波長紫外光照條件,非常適合在活細胞中直接結合并共價捕獲結合蛋白,廣泛應用于活性小分子靶點發(fā)現,脫靶蛋白鑒定和分布成像。
代表性產品如下(部分產品現貨,可定制合成多種化學探針):
產品貨號
產品結構
產品用途
產品/原藥CAS號
02010029
2-(3-(But-3-yn-1-yl)-3H-diazirin-3-yl)
acetic acid,Diazirine-acid
光交聯連接子,
用于化學探針合成
2049109-24-0
02010031
2-(3-(But-3-yn-1-yl)-3H-diazirin-3-yl)
ethan-1-amine,Diazirine-amine
光交聯連接子,
用于化學探針合成
1450752-97-2
02010090
3-(But-3-yn-1-yl)-3-(2-iodoethyl)-
3H-diazirine, Diazirine-iodo
光交聯連接子,
用于化學探針合成
1450754-38-7
02010095
3-(2-Bromoethyl)-3-
(but-3-yn-1-yl)-3H-diazirine
光交聯連接子,
用于化學探針合成
2432830-88-9
02010030
2-(4-(3-(Trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)
acetic acid,4-((trifluoromethyl)diazirinyl)
phenylacetic acid
光交聯連接子,
用于化學探針合成
148058-40-6
02010094
2-(3-Methyl-3H-diazirin-3-yl)
ethan-1-amine
光交聯連接子,
用于化學探針合成
36902-22-4
02010040
雷公藤紅素光親和探針
34157-83-0
02010051
異貝殼杉烯酸光親和探針
6730-83-2
0102E000074
花生四烯酸光親和探針
506-32-1
02010152
脫氧膽酸光親和探針
83-44-3
02010131
膽固醇光親和探針
57-88-5
02010021
白樺酸光親和探針
472-15-1
02010171
二甲雙胍探針
657-24-9
02010048
小檗堿光親和探針
633-65-8
0102E000095
benzoquinoquinoxaline
BQQ光親和探針
207671-99-6
產品名稱
Celastrol probe, Ce-2
Kaurenoic acid probe,KA-1
Arachidonic acid probe
Deoxycholic acid probe, CMX-Q-013
Chol-2
Betulinic acid probe, BA-Xalkyne
Metformin probe, Met-P1
Berberine probe, BBR-1